在新三板市场中，投资者常常会遇到两种常见的股票转让方式——做市转让与协议转让。这两种转让方式虽然都属于新三板市场的交易机制，但在操作模式、流动性以及适用范围等方面存在显著差异。了解它们之间的区别，有助于投资者更好地选择适合自己的投资策略。

首先，在转让方式上，做市转让是指由符合条件的做市商为某只股票提供双边报价服务，即做市商同时报出买入价和卖出价，并以自身资金或证券参与交易。这种模式可以有效提高市场流动性，降低价格波动性，为投资者提供更多便利。而协议转让则是一种更为灵活的方式，买卖双方可以直接协商确定交易价格并完成交割，无需通过第三方平台撮合。这种方式通常适用于大宗交易或者特殊需求场景。

其次，从市场流动性角度来看，由于做市商的存在，做市转让通常具有更高的活跃度和稳定性。对于普通投资者而言，这种方式能够更方便地进行买卖操作，同时也减少了因信息不对称而导致的风险。相比之下，协议转让虽然也具备一定的灵活性，但由于缺乏统一的价格发现机制，可能导致市场价格波动较大，不利于中小投资者参与。

再者，就适用对象而言，做市转让更适合那些具有较高知名度、业绩稳定且发展前景良好的企业。这类企业在引入做市商后，更容易吸引机构和个人投资者的关注，从而提升整体估值水平。而协议转让则更多地被用于非公开市场中的大宗交易，如控股股东减持股份、股权激励计划等特定场合。

最后，值得注意的是，尽管两者各有优势，但并非所有挂牌公司都可以自由选择这两种转让方式。根据全国股转系统的相关规定，只有满足一定条件的企业才能申请采用做市转让，而其他未达标的企业只能采取协议转让的形式。因此，在实际操作过程中，投资者还需结合具体情况进行综合考量。

综上所述，做市转让与协议转让作为新三板市场的重要组成部分，分别代表了不同的交易逻辑和发展方向。对于希望获得良好流动性和稳定回报的投资者来说，做市转让无疑是更好的选择；而对于寻求个性化解决方案的大型机构或特定主体，则可以通过协议转让实现目标。当然，无论选择哪种方式，都需要充分评估自身的风险承受能力和投资目标，确保做出明智的投资决策。